先天性心脏病是小儿最常见的心脏病，临床上常见的有房间隔缺损、室间隔缺损、动脉导管未闭等。研究显示在例患有各种心脏病的患儿中，近50%患儿的身高低于第16百分位，28%患儿低于第3百分位。这证实了先天性心脏病引起的循环呼吸功能不良可以导致生长发育障碍。
先天性心脏病造成小儿生长发育迟缓，主要是因为这些缺陷会造成心脏射出血液的分流，不再像正常的孩子那样从左心室射出的血液全部流到主动脉，再流到全身，患儿心脏的先天缺陷会使左心室射出的血一部分流到了右心室或右心房，引起体循环血量不足，妨碍了身体的各个器官的发育，这些孩子大多会表现为体格较小、消瘦、乏力、多汗和活动后气促，并因肺循环充血而容易得支气管炎。有的孩子先天性二尖瓣关闭不全，主动脉缩窄，肺动脉狭窄，也是先天性心脏病，轻度的生长发育可以不受影响，重度的也会导致生长发育迟缓，身材矮小。
先天性心脏病儿童个子矮小主要是因为循环功能障碍导致，如果手术消除这种障碍，恢复正常的循环功能，生长发育就能恢复正常。早期接受手术，孩子们的循环和生长发育受到的负面影响就较少。
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